home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Celestin Apprentice 5 / Apprentice-Release5.iso / Source Code / Libraries / DCLAP 6d / dclap6d / SeqPups / tables / tob.cod < prev   
Text File  |  1996-07-05  |  3KB  |  95 lines
  1.  
  2. Nicotiana tabacum (Tobacco)
  3.  
  4. 21 genes found in GenBank 63.
  5.  
  6.  Produced by J. Michael Cherry (cherry@frodo.mgh.harvard.edu) with the
  7.  GCG program CodonFrequency.
  8.  
  9.  Duplicates, pseudogenes, mutant and synthetic genes were not included.
  10.  Coding regions were specified using the Feature Table of each entry, then
  11.  checked for accuracy. If more than one stop codon was found the sequence
  12.  was not included.
  13.  
  14. AmAcid  Codon     Number    /1000     Fraction   ..
  15.  
  16. Gly     GGG       55.00      8.07      0.09
  17. Gly     GGA      197.00     28.92      0.33
  18. Gly     GGT      235.00     34.50      0.40
  19. Gly     GGC      107.00     15.71      0.18
  20.  
  21. Glu     GAG      171.00     25.10      0.48
  22. Glu     GAA      188.00     27.60      0.52
  23. Asp     GAT      223.00     32.74      0.64
  24. Asp     GAC      124.00     18.20      0.36
  25.  
  26. Val     GTG      110.00     16.15      0.24
  27. Val     GTA       92.00     13.51      0.20
  28. Val     GTT      178.00     26.13      0.39
  29. Val     GTC       82.00     12.04      0.18
  30.  
  31. Ala     GCG       39.00      5.73      0.08
  32. Ala     GCA      138.00     20.26      0.27
  33. Ala     GCT      237.00     34.79      0.46
  34. Ala     GCC      106.00     15.56      0.20
  35.  
  36. Arg     AGG       81.00     11.89      0.26
  37. Arg     AGA      104.00     15.27      0.33
  38. Ser     AGT       89.00     13.07      0.18
  39. Ser     AGC       79.00     11.60      0.16
  40.  
  41. Lys     AAG      206.00     30.24      0.59
  42. Lys     AAA      144.00     21.14      0.41
  43. Asn     AAT      179.00     26.28      0.50
  44. Asn     AAC      182.00     26.72      0.50
  45.  
  46. Met     atg      160.00     23.49      1.00
  47. Ile     ATA       64.00      9.40      0.18
  48. Ile     ATT      184.00     27.01      0.53
  49. Ile     ATC       99.00     14.53      0.29
  50.  
  51. Thr     ACG       37.00      5.43      0.10
  52. Thr     ACA      118.00     17.32      0.30
  53. Thr     ACT      159.00     23.34      0.41
  54. Thr     ACC       75.00     11.01      0.19
  55.  
  56. Trp     TGG      115.00     16.88      1.00
  57. End     TGA       10.00      1.47      0.45
  58. Cys     TGT       95.00     13.95      0.57
  59. Cys     TGC       71.00     10.42      0.43
  60.  
  61. End     TAG        6.00      0.88      0.27
  62. End     TAA        6.00      0.88      0.27
  63. Tyr     TAT      120.00     17.62      0.53
  64. Tyr     TAC      105.00     15.41      0.47
  65.  
  66. Leu     TTG      166.00     24.37      0.32
  67. Leu     TTA       63.00      9.25      0.12
  68. Phe     TTT      181.00     26.57      0.55
  69. Phe     TTC      146.00     21.43      0.45
  70.  
  71. Ser     TCG       31.00      4.55      0.06
  72. Ser     TCA       88.00     12.92      0.18
  73. Ser     TCT      139.00     20.41      0.28
  74. Ser     TCC       71.00     10.42      0.14
  75.  
  76. Arg     CGG       11.00      1.61      0.03
  77. Arg     CGA       40.00      5.87      0.13
  78. Arg     CGT       61.00      8.95      0.19
  79. Arg     CGC       19.00      2.79      0.06
  80.  
  81. Gln     CAG       92.00     13.51      0.39
  82. Gln     CAA      143.00     20.99      0.61
  83. His     CAT       74.00     10.86      0.52
  84. His     CAC       67.00      9.84      0.48
  85.  
  86. Leu     CTG       43.00      6.31      0.08
  87. Leu     CTA       60.00      8.81      0.11
  88. Leu     CTT      112.00     16.44      0.21
  89. Leu     CTC       80.00     11.74      0.15
  90.  
  91. Pro     CCG       17.00      2.50      0.05
  92. Pro     CCA      132.00     19.38      0.37
  93. Pro     CCT      149.00     21.87      0.42
  94. Pro     CCC       57.00      8.37      0.16
  95.